La Fondazione Amilcare è diretta dal 1° di febbraio 2019 da Gian Paolo Conelli. Dal 1999 fino al mese di gennaio 2019 la Fondazione era stata diretta da Raffaele Mattei.
L’équipe di direzione che gestisce gli aspetti amministrativi della Fondazione è composta da Maria Gustafsson
(contabile) e Lorenza Carrara (segretaria e contabile).
La sede della Direzione è situata in Via Luganetto 4 a Viganello.
Gian Paolo Conelli è nato il 5 marzo 1975 ed è domiciliato a Giubiasco. Ha frequentato le scuole di Arzo e in seguito le scuole medie e il Liceo di Mendrisio. Dopo aver terminato gli studi in Scienze Sociali all'Università di Losanna, nel 1999 ha ottenuto la Maîtrise ès Sciences Sociales in antropologia della salute e sociologia.